参加课程是游戏的核心玩法之一，玩家需要通过地图进入城堡主楼，选择对应的教室参与课程。占卜课、黑魔法防御课等课程均分布在霍格沃茨学院的不同区域，例如占卜课教室位于城堡上方，需调整视野才能发现。课程通常分为教学模式和实战匹配两部分，前者引导玩家掌握基础操作，后者则需与其他玩家协作完成挑战。参与课程需消耗积分（体力），积分不足时无法进入课堂。
课程评分由通关时长、卡组伤亡情况以及考核完成度综合决定。完美通关需满足所有条件，例如无人阵亡、快速击败敌人或正确回答教师提问。部分课程如普通攻击课需特定策略：开场使用速速禁锢控制敌人，走位避开远程攻击，优先处理威胁较高的目标。魔法史、魔药课等理论课程则需注意剧情对话中的知识点，考核问题往往隐藏其中。
每日课程是推进主线剧情的关键，完成课程可解锁宝箱获取卡牌、金币等奖励。课程类型包括咒语练习、神奇动物驯服等，不同课程对应不同卡组搭配。例如对抗炸尾螺和巨怪时，需携带控制类咒语卡和召唤卡；而魔咒课可能要求玩家熟练使用漂浮咒或火焰咒。课堂学分可用于兑换魔药配方和材料，每日上限为200分，建议优先完成中午的学院活动以快速积累学分。
高阶课程如禁林探险需组队完成，每日最多获取3条线索。紫色和红色线索每周有奖励次数限制，建议合理分配挑战顺序。无名之书副本还原原著剧情，通关后可解锁隐藏彩蛋和特殊奖励。参与课程前需检查卡组强度，低等级卡牌可能导致战斗超时或评分下降。若课程进度受阻，可优先提升卡牌等级或调整回响搭配。
课程参与时间需注意特殊安排，例如学院活动每天开放两次（12:00-13:00和20:00-21:00），结束后发放学院烟花奖励。舞会和魁地奇训练等限时活动虽不属常规课程，但能补充宝箱进度。社团活动每周固定时间开启，提供额外资源获取渠道。合理规划课程顺序可提高效率，例如先完成主线关联课程再参与限时活动。
